バリー (エズラ・ミラー) はスーパーパワーを使って過去に戻り、歴史を変えて家族を救いたいと考えています。しかし、彼の行動は誤って未来をも変えてしまいます。この新しい未来では、ゾッド将軍 (マイケル シャノン) が戻ってきて、世界を破壊する脅威にさらされています。バリーは、引退した全く違うバットマン（マイケル・キートン）を説得して、投獄されているクリプトン人を救ってくれるよう説得できない限り、孤立無援となるが、このバットマンは彼がよく知っているスーパーマンではない。結局のところ、バリーの唯一の希望は、運命に抗して自分をこの世界から救い、彼が知っている未来に戻ることです。しかし、たとえバリーが究極の犠牲を払ったとしても...彼は本当に宇宙全体を元の軌道に戻すことができるのでしょうか?