トム・クルーズ演じる「ローン・レンジャー」ピーター・ミッチェルの父親は、優れた戦果を誇るベテランパイロットであり、父親のようなヒーローになることを決意している。ついにその機会が到来し、彼と警察官「バカグース」ニック・ブラッドショー（アンソニー・エドワーズ演じる）は、最も厳しい飛行訓練を受けるためにトップガン訓練基地に送られることになった。しかし、「ローン・レンジャー」の訓練は思うようには進まず、一緒に訓練した「アイスマン」トム・カザンスキー（ヴァル・キルマー役）からも批判の声が上がっている。 。同じ頃、「ローン・レンジャー」は美しい女性教官チャーリー（ケリー・マクギリス）と出会い、二人は密かな恋心を抱き、これをきっかけに失意気味だった「ローン・レンジャー」は自信を取り戻した。卒業前の訓練で、「ローン・レンジャー」と「ベン・グース」は再び一緒に飛行しましたが、モーターの故障により、「ローン・レンジャー」と「ベン・グース」は海に飛び込むことになりました。 「ベン・グース」は残念ながら亡くなりました。この事件は「ローン・レンジャー」に大きな打撃を与え、彼はすでに学業の失敗で落ち込んでおり、パイロットになる夢を完全に諦めようとさえ思っていた。 「ローン・レンジャー」はついに心の壁を乗り越え、青空に戻ることができるのか？