今シーズンの物語は引き続き5人の主人公を中心に展開します。 9年間愛し合ってきたマシュー（ジェイソン・シーゲル）とリリー（アリソン・ハニガン）は、結婚式の準備で忙しい中、ついに結婚を決意したが、突然、花嫁となるリリーがサンフランシスコへ行ってしまう。マシューは何も言わずに一人で美術の勉強をしたかったので、結婚式をキャンセルしなければならなかった。 3か月後、リリーはニューヨークに戻り、マシューと和解したいと考えていましたが、傷心のマシューはリリーを許すでしょうか？一方、互いに好意を寄せるテッド（ジョシュ・ラドナー）とロビン（コビー・スマルダーズ）は、様々な事件や紆余曲折を経て、ついに…お互いの本当の気持ちを理解し、一緒になることを決意する。プレイボーイのバーニー (ニール・パトリック・ハリス) はまだ独身生活を楽しんでいますが、他の点では彼は謎に満ちています。テッドと他の 4 人は、バーニーのことを実際には理解していないことに気づき、全員がバーニーに興味を持ち始めました。