マーティン（マイケル・J・フォックス）はガールフレンドと再会するために現実世界に戻ってきたところだったが、ブラウン博士（クリストファー・ロイド）は心配そうに彼らを30年後の未来の世界に連れて行った。強盗に参加したとして逮捕されたダンは投獄され、医師は悲劇が起こらないようにマーティンを連れて行こうとする。いくつかの対処の後、2人の子供たちは無事救出されましたが、3人が現実の世界に戻った後、世界はベブ（トーマス・F・ウィルソン）によって支配されていることがわかりました。ジョージは悲劇的に亡くなり、彼の母親ロレイン（リー・トンプソン）がベブの妻であることが判明しました。このすべては、タイムマシンの秘密が未来の老ベブによって偶然発見されたために起こりました。彼は問題を引き起こすために密かに戻ってきました。その結果、全世界が彼の支配下に置かれました。マーティンと医師は、世界を元の軌道に戻すことを願って、再び時間の旅に乗り出します。