「風の街」風の通りで、左正太郎と相棒のフィリップ、所長の鳴海明日子は探偵事務所を営んでいる。一見平和に見えるフェンドゥの裏では、一般人をドーパントに変える「邪悪なガイア貯蔵帯」を地下で流通させている謎の組織が存在していた。そして、数々の奇怪な事件を起こす謎の組織の中核である「園崎家」の面々は、風に大きな影響を与えている。ドーパントに挑み、奇怪な事件を起こした翔太郎とフィリップは、6枚の「ガイアメモリ」を使って合体して仮面ライダーWに変身し、園崎家と果敢に戦った。園崎家の目的とは？仮面ライダーWとフィリップの謎に満ちた過去とは？数々の謎を秘めて、仮面ライダーWの戦いが始まる…。