2000年。長野山脈の黒山で謎の遺跡の発掘作業が進められている。遺跡の棺には石化したベルトを巻いた古代の死体が納められていた。調査チームが棺を開けたとき、不倶戴天の敵「グランジ」が目覚めたとは、彼らはほとんど知りませんでした。直後、調査隊は未確認生命体に襲われ全員死亡。捜査班殺人事件の手がかりを掴むため、遺跡現場を捜査していた長野県の刑事・一条薫の前に、突如、一人の青年が無断侵入した。一条に呼び止められた青年は、冒険者・五代雄介と名乗った。ついに復活した未確認生命体は長野郊外に現れ、勝手に人々を襲い始め、警察署にも突入した。その場に居合わせた祐介は、遺跡から発掘され警察が保管していた帯状の遺物に戦士の面影を感じ、冒険者の直感で腰に装着した。幽助の体も鎧で覆われ、変身後、警察署を襲撃した未確認生命体を激闘の末に倒した幽助。大都市・東京に未確認生命体が次々と出現する中、五代雄介は周囲の人々を恐怖から解放し、その笑顔を守るために戦う決意をする…新世代の仮面ライダー「クウガ」誕生！