キャプテン・アメリカのスティーブ・ロジャース（クリス・エヴァンス）は、世界平和を維持し続けるために新生アベンジャーズを率いています。しかし、アベンジャーズのメンバーが任務中に誤って民間人に多数の死傷者を出したため、政治的圧力が生じ、政府はアベンジャーズを管理、指導するための規制システムを採用することを決定した。その結果、同盟は 2 つの派閥に分裂しました。1 つはメンバーの自由を維持し、政府の介入なしに世界を守ることを主張するスティーブ・ロジャースが率いるもので、もう 1 つはトニー・スターク (ロバート・ダウニー・ジュニア) を支持することを驚くべきことに決定しました。政府の規制と責任のシステム。謎のバッキー（セバスチャン・スタン）は内戦の重要人物のようだ…。