暑い夏の日、出木杉さんは友達に「宝島」の話をしました。のび太（声：大原恵美）は、ファットタイガー（声：木村昴）、シャオフ（声：関智一）、しずか（声：粕木由美）の前で、海賊の宝を見つけたと大はしゃぎで自慢していた。もちろん、最後は頼れる親友のドラえもん（声：水田わさび）に頼るしかない。ドラえもんがひみつ道具「宝島地図」を取り出したのび太は、ひょんなことから太平洋の真ん中に金銀財宝のある新たな島を発見する。その後、仲良したちは出航し、太平洋の中心を目指しました。最初の幸福の興奮が冷めた後、謎の海賊の一団が全員を止めました。乱闘の末、別の女の子として相手にさらわれてしまった静香。同じ頃、のび太たちは島から少年フロック（声：山下大輝）を救出した。しずかを救出するため、彼らは海賊の足跡を追い、広大な海を渡った…。