物語の舞台は1926年のニューヨーク。当時、魔術師に対するノー・マジの抵抗は頂点に達し、メアリルー（サマンサ・モートン）率いる反魔術組織が頻繁に活動していた。同時に、街路や路地では様々な災害や事故が時折発生し、魔法界の存続も危うくなり、魔法省全体はかつてない緊張感に陥った。この時点で、魔法動物を研究して世界中を旅している魔法動物学者のニュート (エディ・レッドメイン) がニューヨークに到着しました。彼の魔法のスーツケースには、途中で救出した 10 種類の魔法動物と彼のあらゆる行動が入っていました。は魔法省所属の元闇祓いであるティナ（キャサリン・ウォーターストン）の監視下にあった。事故により、ノーマジ・ジェイコブ（ダン・フォグラー）が誤ってニュートのスーツケースを奪い、箱の中に隠されていた魔法動物を解放してしまいました。そのため、ニュート、ティナ、ジェイコブ・ブーとティナの妹クイニー（アリソン・スドル）は、旅に出なければなりませんでした。魔法動物を探す旅。