ロケット・アライグマ（ブラッドリー・クーパー演じる）は、スター・ロード（クリス・プラット演じる）、ガモーラ（ゾーイ・サルダナ演じる）、ドラックス（デイブ・バウティスタ演じる）を含む大祭司アイシャ（エリザベス・デビッキ演じる）のエネルギーバッテリーを盗んだ。他のグループは後者が派遣した艦隊によって攻撃された。謎の人物が宇宙船に乗ったガーディアンズ・オブ・ギャラクシーを救ったが、その宇宙船を運転していたのは他ならぬスター・ロードの実の父親、エゴ（カート・ラッセル演じる）だった。エゴのリーダーシップの下、スターロード、ガモーラ、ドラックスはエゴが作った惑星にやって来たが、残りのメンバーは損傷した宇宙船の修理に着手した。そこではアイーシャが自分の復讐のためにスター・ロードを捕まえるようヨンドゥ（マイケル・ルーカー）に託し、ガモーラはイーゴの優しい顔の下に隠された巨大な陰謀に徐々に気づいていく。