ルルーシュはもともと帝国の王子でしたが、母親が殺された後、盲目の妹とともに人質としてエリア11（旧日本）に追放されました。そこで彼らは日本の王子スザクと出会い、三人は素晴らしい子供時代を過ごしました。帝国はついに第11地区を完全占領した。ルルーシュと妹の平穏な生活は再び奪われ、スザクとは離れ離れになってしまう。ルルーシュと妹は正体を隠し、一見平凡な学生生活を送っていた。しかし、ルルーシュの帝国への憎しみは止まらなかった。彼は帝国を滅ぼし、妹が幸せに暮らせる世界を作ることを望んでいます。それは、謎の少女CCの出現により、もはや手の届かないものになる。この時、スザクも再び彼らの生活に現れましたが、残酷な現実は幼馴染みが子供時代の思い出を振り返ることを困難にしました。ここには正義も悪も、闇も光もなく、あるのは難しい選択と予測不可能な明日だけだ。