十数年前、木ノ葉忍者の里を強大な怪物「九尾の妖狐」が襲った。当時の四代目火影は、自らの命と引き換えに「九尾の妖狐」を封印しようと尽力した。生まれたナルトについて。ようやく平和を取り戻した木ノ葉の里だったが、村人たちはナルトを「九尾の妖狐」のような化け物扱いし、皆から疎まれていた。幼い頃から孤独で無力だったナルトは10年以上経ち、木ノ葉の里の忍者学校に入学し、親友のサスケとサクラに出会った。サスケはうちは家の子孫の一人で、子供の頃、すでに優れた忍術を持っていた忍者であり、家族全員を殺し、その後、常に大蛇丸を破壊しようとしているグループ、サスケに加わりました。幼い頃から兄を超え、家族の仇を討つことを誓っていた。ナルトたちは忍者学校で教官カカシの丁寧な指導を受け、カカシの助けを受けながら次々と試練を乗り越え成長していく！