勉強しかできない内気な大学生・金木研（窪田正孝）は、ひょんなことから出会った美少女・神城利世（蒼井優）と同じ趣味を持つ。意外にも、一定期間の交際の後、李施は恐ろしい顔をして金武を生きたまま食べようとした。李施は人間を唯一の食料と考える「グール」と呼ばれる突然変異種であることが判明した。危機一髪で李施が事故で亡くなり、重傷を負ったカネキは李施から臓器を移植されるが、彼も“喰種”の一員となってしまう。回復した後、人間の食べ物が食べられなくなったカネキは、空腹に苦しんでいたところ、カフェで働くトーカ（清水富美加）の紹介で、“喰種”が集まる安全地帯で暮らすことになる。一方、CCGの上級捜査官・間藤剛（大泉洋）とその部下たちは、“喰種”の行方を追って奔走していた。人間とグールの間の戦争が今まさに勃発しようとしている... この映画は同名コミックを原作としています。