若いプロフェッサー X チャールズ (ジェームズ マカヴォイ演じる) とマグニートー キング エリック (マイケル ファスベンダー演じる) は、同じ志を持った親友の 2 人です。彼らは自分たちの超能力を最初に発見し、他の数人のミュータントとともに CIA と協力しました。エリックの超大国化を引き起こしたナチスの戦争屋シャオ（ケビン・ベーコン）は核戦争を引き起こそうとしており、あらゆる手段を使って米ソ間の対立を引き起こそうとしていた。エリックとチャールズはショーの陰謀を阻止するためにショーのミュータントと戦っていた。シャオはソ連にキューバ危機を引き起こすよう奨励した。チャールズとエリックはそのニュースを知った後、湾岸でシャオのミュータントと決闘を始めた。最終的に、シャオはチャールズとエリックの協力によって排除されました。しかしその過程で、エリックは次第にシャオの政治的見解に影響を受け、チャールズとの間に亀裂が生じてしまう。この湾岸の戦いを経て、エリックとチャールズはついに決裂し、一方はプロフェッサーに..