新年、美秀学園理事長の桜井涼子（黒木瞳）は、エリートたちを率いて湘南へ赴き、統合美秀湘南高等学校の設立を発表した。 2年A組の教頭は内山田洋（田山良成）、副担任は鬼塚英吉（AKIRA）が務める。時を同じくして、弾間竜二（城田優）と冴島俊之（山本裕典）も諸事情で故郷に戻り、かつて湘南を騒がせた不良たちが湘南に再会する。鬼塚と2年A組を共同で担任する傲慢な女教師・藤川保奈美（比嘉愛未）、宮地あかり（三吉彩花）、宇佐美太一（佐野玲於）、芹沢公平（竜星涼）、一見、活気にあふれ幸せな新世代のように見えますが、それぞれが身体的、心理的トラウマを抱えています。 GTO鬼塚はただ黙って見過ごすことはできず、再びユニークな方法で行動を起こした… この映画は、藤沢とおるの同名コミックを映画化したものです。