ルーシーおばさん (イメルダ・スタウントンの声) の誕生日が近づいており、パディントン (ベン・ウィショーの声) は、一生忘れられない贈り物を叔母に贈ることにしました。結局、パディントンは立体の絵本を選びましたが、この絵本こそが、絵本を買うためのお金を貯めるため、失敗を重ねながらも始めることを決意しました。 , パディントンはついに自分に合った仕事、窓拭きを見つけました。パディントンの貯金が目標額に達しようとしたそのとき、現場に現れたとらえどころのない泥棒によって絵本が盗まれ、容疑者として逮捕され、ついには投獄されてしまう。刑務所内ではパディントンは愛と勇気を頼りに壁内の活気のない雰囲気を変えたが、刑務所の外ではブラウン一家はパディントンの不満を晴らす機会を決して諦めなかった。