シャオジー（声：松本梨香）は鎮新鎮出身で、ポケモンのトップトレーナーになることが目標です。トレーナーとしての旅を始めようとしたある日、遅刻のため初期エルフを入手できなかった。それを見たオキ博士（声：石塚運昇）は、モンスターボールに入ろうとしないいたずらっ子のピカチュウを、迷子になった青年にプレゼントした。こうして二人はポケモンの旅に出発した。旅の途中、二人の間にあった壁は徐々に崩れ、仲間の聖子（声：佐藤観里）と宗治（声：本郷奏多）に出会い、ホウオウの伝説を聞く。 「虹の羽根に導かれ、ホーキングと出会った者は、虹の戦士となる…」 本作の劇場版は、アニメ『ポケットモンスター』シリーズの第20作目となる。映画のあらすじは、アニメ『ポケットモンスター』シリーズの第1話！決断はあなた次第です！ 「『ポケットモンスター』の適応作では、シャオジーとピカチュウがポケモンマスターになるための冒険に乗り出す物語が描かれています。