オートボットとディセプティコンの戦いは何世紀にもわたって続き、決して終わることがなく、彼らの子孫であるビッグマックと原初の獣は、先史時代に新たな戦いをもたらしました。新しいエネルギーを見つける途中、ティラノサウルス・レックス（声：デヴィッド・ケイ）はこの原始的な獣に時空を超えて先史時代の地球へジャンプするよう命令し、ビッグ・マックもチンティアン・シェン（声：ギャリー・チョーク）の指導の下に従った。両者の綱引きは続き、やがてすでに地球に定住しているエイリアン・ウォーカーも巻き込まれるようになる。時空を超えた者たちが運ぶ未来の情報は異星人たちを恐怖させ、戦いは激化する。その後、ティラノサウルス・レックスはオートボットが地球に残した戦艦アークを発見し、ディセプティコンの敗北の歴史を変えるため、眠っていたオプティマス・プライムを破壊しようとした。全宇宙の命運を賭けた戦いは太古の昔から始まっていた……。