クラリー (リリー・コリンズ) は物心ついた頃からブルックリンに住んでおり、シングルマザーのジョセリン (レナ・ヘディ) とともに質素で平和な生活を送っています。しかし、彼女は突然信じられない衝撃的なものを目にし、母親も激しい衝突の末に失踪してしまいました。クラリーは親友のサイモン (ロバート・シーハン) と一緒に母親を探しているうちに、シャドウ ハンターの世界に隠された暗い秘密と、より邪悪な危険な力を発見し始めました。何世紀にもわたって、半天使のシャドウハンターは、悪の勢力から人類を静かに守ってきました。悪魔、魔法使い、吸血鬼、狼男、その他の超自然的な生き物に囲まれた影の世界が、クラリーと若い影ハンターのジェイス（ジェイミー・キャンベル・バウワー）、イザベラ（ジェマイマ・ウェスト）、エリック（ケビン・ゼガース）を歓迎します。クラリーの母親の未来を担い、悪者たちに聖杯を奪われないよう力を合わせて守った。若いクラリーは、これまで知られていなかった自分の超能力と勇気を発見し、危険な敵に対する強力な新たな戦闘力であることを証明しました...