平和な街見滝原は、魔法少女の鹿間まどか（CV：結城あい）、美樹さやか（CV：喜多村英梨）、巴麻美（CV：水橋かおり）、佐倉杏子（CV：野中葵）たちによって守られている。そして何度も、彼らは人間の魂の奥深くに生じる「悪夢」を打ち破り、最も大切にしている街、家族、友人を全力で囲みました。この日、まどかのクラスに美少女・ほむらシャオミ（声：斉藤千和）が転校生としてやって来て、ひょんなことからシャオメイも魔法少女の一人であることを知る。その後、5人の魔法少女は相次ぐ悪夢による危機を協力して解決した。彼らの友情は深く、非常に仲睦まじく過ごしていますが、シャオメイは周囲に常に存在する不服従の雰囲気に漠然とした不安を感じています。ある日、彼女は京子に何が起こっているのかを知るために一緒に風見原に行くように頼みました、しかし、二人は多くの時間を費やし、見滝原から出ることができませんでした。シャオメイはついに、自分と友達が何者かによって魔女の結界に封印されているらしいことに気づきました。終わりのない輪廻と愛の幻想が、少女たちを果てしない混沌の深淵へと突き落としていく――。