世界的な怪獣災害の発生後、地球の内外からの怪獣や異星生命の襲撃に対処するため、世界各国は1966年に地球防衛軍（GGF）を設立した。今日、人間による自然破壊と地球温暖化はますます深刻になっています。ある夜、宇宙貝怪獣バザンジアが現れた。地球防衛軍の掃討作戦は難航し、ヒルゼンヒト率いる特殊部隊は絶体絶命の窮地に陥る。その時、謎の巨人がまばゆい光を持ってやって来た。これは、宇宙飛行士の間で何十年も噂されている、コードネーム「ウルトラマン」という正体不明の大型宇宙人です。その後、ストリンガーは司令部に呼び出され、突然、特殊怪獣対応分遣隊（SKaRD）の司令官となる任務を与えられた。 SKaRDは秘密裏に組織された特別なモンスター対応チームです。その指揮下にあるこの特殊部隊は、主に巨大怪獣型ロボット・アスガロンを駆り、怪獣災害と戦う。同時にバザンジアの戦いに現れたウルトラマンが排除すべき敵なのか調査するよう命じられる。 「私が対処します」。ウルトラマンブレイズの光に包まれた今、キャプテン・ストリンガーは新生SKaRDの特別メンバーとともに、正義の心を胸に新たな怪獣との戦いに身を投じる！