冷戦時代、ブルース・バナー（エリック・バナ）の父親は米陸軍の科学者で、米軍のスーパー兵士を生み出すため、遺伝子組み換えによって人間に超能力を獲得させる方法の研究に熱心に取り組んでいた。しかし、彼のプロジェクトは米軍からの支援を受けておらず、実験を完了させるために、狂った父親は生まれたばかりのバナーに対して遺伝子実験を行った。数年後、バナーは優れた科学者となり、軍用の新しい高エネルギー爆弾の開発に専念しました。定期的な実験中、操作ミスにより、バナーは同僚を守るために強力なガンマ線放射のバーストにさらされてしまいました。この放射能爆発で普通の人なら間違いなく死ぬだろうが、バナーは生き残った。何年も前、彼の父親が彼に行った実験も、この核放射のおかげで効果を発揮しました。バナーが怒ると、彼の体に神秘的な力が誘発され、超破壊力と抵抗意識を持った無意識のハルクに変わります。そこで、徹底した調査を行うため、米軍はハルクの追跡と迎撃を開始した…。