古代インド神話の「ヤクシャ」は半神とされ、ブラフマーの足の裏で生まれました。その姿は、ある時は美しい若者であり、ある時は老小人であり、慈悲深く親切な二つの性格を持っています。そして、一卵性双生児の夕末志津と雨宮凛（伊藤英明）の相互補完性を象徴する残酷さ。二人はハイテクノロジーによって生み出され、常人を超えた能力とIQを持った双子だが、育った環境が全く異なるため、性格も運命も全く異なる。兄のジンは平凡で幸せな幼少期を過ごし、その後アメリカに留学して科学研究者となったが、弟のリンは秘密で育てられ暗い心を抱えていた。何も共通点のなかった二人はジンの帰還によって変わってしまったが、島に調査に行きパンドラの箱を開け、罪深く美しい物語がすべて明らかになった。そして、夜叉が何者なのか、実はもう明らかになっていません… この映画は、漫画家・吉田秋生の同名コミックを原作としています。