作家のベンジャミン・スミス（マット・デイモン演じる）はもともと冒険が大好きだが、半年前に妻を亡くした痛みから未だに離れられず、息子のディランと末娘のロキシーは失った生活に適応できていない。母親も窃盗とダークアートの創作で退学になり、弟のダンカンの忠告にも耳を傾けず、新しい恋に前向きになることを拒否し、子供たちと新しい環境に移ろうと計画した。生き続けること。そしてベンジャミンの新しい家は、放棄された動物園だったことが判明！ロシュの動物たちとの友好的な触れ合いを見たベンジャミンは、今も多くの動物が暮らすこの野生動物園を引き継ぐことを決意し、園長ケリー（スカーレット・ヨハンソン）率いる残されたチームを率いて動物園の改修を夏前に行うことを願った。開園、動物園の再開と家族の新しい生活を歓迎します...