パーティーで医師が透明人間に殺された。刑事のターナー（ピーター・ファシネリ）とリサが現場を捜査していたところ、この事件は国防省に引き継がれ、彼らの任務は女性を守ることだと知らされた。生物学者のダルトン（ローラ・リーガン）。一方、透明人間は医師を殺害する前に、自分の体を良くする緩衝薬を提供できるのはダルトンだけであることを知っていた…ターナーとリサはダルトンを守っていた夜、透明人間に襲われ、リサは職務中に死亡した。軍が突然現れたとき、ターナーはダルトンと自分自身が透明な人々を罠にはめるために軍によって使われた単なる餌だったことに気づいた。怒ったターナーはダルトンを連れて軍の支配から逃れ、透明人間と軍との切っても切れない関係の背後にある真実を語るようダルトンに要求した。時を同じくして、軍はターナーを追撃対象とし、軍とトランスペアレント、ターナーを巡る陰謀と追跡が展開され始める。