過酷な運命を背負った少女ルーン・バロット（CV：林原えみ）は、強敵ボイド（CV：磯部勉）と激闘を繰り広げるが、その瀬戸際に万能兵器と呼ばれる犯罪捜査官・ウフクが現れた。そこにドクター・ケ（声：サピエン・ヤシマ）が現れ、瀕死のバロットを救う。再び目覚めたバロットは、伝説の禁断科学発祥の地「パラダイス」の研究室にいた。そこで再び数々の奇妙な発明を目の当たりにし、「パラダイス」と3人の博士の過去を知る。調べた結果、カジノのチップにシェール（声：中井和哉）の記憶が隠されていることが判明した。バーロットはシェールの過去を追うため、ギャンブラーに変装し、危険なカジノに足を踏み入れた…。 この映画は沖縄のSF小説を原作としたもので、「ガール・イン・ザ・シェル」三部作の第二部（他二部）です。は「圧縮」と「排気」です）。