うっそうとした静かなメンフクロウの森で、フクロウのノクタスは妻と子供たちとともにそびえ立つ木の枝に住んでいます。彼女の息子サウロン (ジム・スタージェスの声) は、ガーディアンの伝説に非常に夢中になっています。その昔、鋼鉄のくちばしをした邪悪な「純血種」（ワラフクロウ）の王がフクロウの民を抑圧し、危機の瞬間に守護者たちが前に出て王とその手下たちを打ち破ったと言われていますが、敗者は決して屈しませんでした。復讐のアイデアを思いつきます。古代の伝説に憧れていたサウロンは、弟のクルド（声：ライアン・クワンテン）を激怒させて木から突き落とした。まだ自由に飛ぶことを覚えていない二人の小さな男は危険な地面に落ち、さまざまな獣からの攻撃を避けますが、邪悪なハンターの標的になることは避けられません。兄弟たちは他の種類のフクロウたちとともに捕らえられ、神秘的な聖フクロウ学校に連れて行かれ、そこで厳しい訓練を受け、さまざまなスキルを学びました。フクロウ王国で長らく眠っていた戦争が再び勃発しようとしています。この映画はキャサリン・ラスに基づいています。キーの古典的な児童文学の改作です。